多平臺、多方法RNA文庫構(gòu)建
RNA是以DNA的一條鏈為模板，以堿基互補配對原則，轉(zhuǎn)錄而形成的一條單鏈，主要功能是實現(xiàn)遺傳信息在蛋白質(zhì)上的表達，是遺傳信息傳遞過程中的橋梁，主要存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中。
眾所周知，total RNA中95%以上都是核糖體RNA（rRNA），可rRNA卻非常保守，在不同的組織、器官當(dāng)中的表達極度穩(wěn)定； 而只占total RNA總量2%-3%的mRNA在RNA當(dāng)中信息含量卻最為豐富，因此mRNA成為人們在科學(xué)研究中的重要關(guān)注點。
組織或細胞總RNA中各種RNA分布餅狀圖
而某個物種的特定組織或細胞在某一生理功能狀態(tài)下發(fā)生的mRNA產(chǎn)物的轉(zhuǎn)錄，即轉(zhuǎn)錄組，是基因組遺傳信息傳遞和表達的重要步驟和過程。
通過高通量mRNA測序可以獲得大量轉(zhuǎn)錄本序列信息，定量基因轉(zhuǎn)錄表達水平，獲得基因組轉(zhuǎn)錄區(qū)域及其位點信息等，在基因組序列拼接注釋、樣品間基因轉(zhuǎn)錄差異表達及其功能研究等方面有重要作用。可從整體水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu)，揭示特定生物學(xué)過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機理，已被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
RNA樣本的建庫質(zhì)量對于后續(xù)上機測序至關(guān)重要，可直接影響后續(xù)結(jié)果的分析。因此，一個好的建庫試劑盒對于RNA測序至關(guān)重要。全式金目前已推出3款RNA建庫試劑盒，分別適用于Illumina和MGI平臺，均具有高數(shù)據(jù)質(zhì)量、高文庫轉(zhuǎn)化率的特點。
常規(guī)RNA建庫
? TransNGS? RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina?
本產(chǎn)品是針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的可用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，在5 h之內(nèi)可將1-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。
● 文庫構(gòu)建原理示意圖
● 與競品的比較
1 μg、100 ng 人血總RNA樣品去除rRNA后(TransGen, KD101)，分別使用TransGen、Company N和Company V建庫產(chǎn)品進行建庫測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量、基因表達水平以及相關(guān)性方面與競品相比，性能一致。
? 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
? 比對區(qū)域分布
? 基因表達及差異分析
? 相關(guān)性分析
快速RNA建庫
? TransNGS? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina?
本產(chǎn)品是針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的專用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復(fù)與加A反應(yīng)，中間不需要純化步驟，極大地簡化了操作流程，縮短了建庫時間，可在4 h之內(nèi)將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。
● 文庫構(gòu)建原理示意圖
● 與競品的比較
使用 mRNA 純化試劑盒對人、小鼠、小麥和煙草的總RNA進行mRNA捕獲，其中人和小鼠投入200 ng總RNA，小麥和煙草投入1000 ng總RNA；分別使用TransGen和Company V建庫試劑盒進行RNA文庫構(gòu)建，文庫分選后檢測文庫產(chǎn)量、峰型，并進行測序分析。
? 文庫產(chǎn)量
? 建庫峰型
?測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
?相關(guān)性分析
? TransNGS? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for MGI?
本產(chǎn)品是針對MGI高通量測序平臺開發(fā)的專用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復(fù)與加A反應(yīng)，中間不需要純化步驟，極大地簡化了操作流程，縮短了建庫時間，可在4 h之內(nèi)將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。
● 文庫構(gòu)建原理示意圖
● 與競品的比較
使用mRNA純化試劑盒對人、小鼠和擬南芥的總RNA進行mRNA捕獲，其中人和小鼠投入200 ng總RNA，擬南芥投入1000 ng總RNA；分別使用TransGen和Company V建庫試劑盒進行RNA文庫構(gòu)建，文庫分選后檢測文庫產(chǎn)量、峰型，并進行測序分析。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品與Company V產(chǎn)品性能一致。
?文庫產(chǎn)量
?建庫峰型
?測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
?相關(guān)性分析
相關(guān)產(chǎn)品推薦
? TransNGS? rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
●產(chǎn)品特點
? 可有效去除人/小鼠/大鼠高達99%的ribosomal RNA。
? 提供Control qPCR Primer Sets，檢測去除前后ribosomal RNA和非ribosomal RNA含量的變化。
●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
1 μg人(Human, H)、小鼠(Mouse, M)和大鼠(Rat, R)總RNA樣品，分別使用TransGen和Company K產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致，甚至優(yōu)于競品。
? TransNGS? rRNA Depletion Kit (Bacteria)
●產(chǎn)品特點
? 可有效去除各種細菌高達99%的ribosomal RNA。
? 操作簡便。
●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
2 μg大腸桿菌(Escherichia coli, E. coli)總RNA樣品，分別使用TransGen、Company V和Company I產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致。
● 成功測試菌種 (rRNA Rate < 5%)
? TransNGS? rRNA Depletion Kit (Animal)
●產(chǎn)品特點
? 可有效去除各種動物高達99%的ribosomal RNA。
? 操作簡便。
●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
2 μg斑馬魚(Zebra fish, Zebra) 總RNA樣品，分別使用TransGen和Company I產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致。
●成功測試物種 (rRNA Rate < 10%)
? MagicPure? mRNA Kit
●產(chǎn)品特點
? 操作簡單。
?提取mRNA得率高，純度高。
?適用于磁棒式高通量核酸提取儀。
●文庫產(chǎn)量
分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對人、大鼠、小鼠、煙草、百合、番茄、大豆、擬南芥、小麥和水稻的總RNA進行mRNA捕獲，其中人、大鼠和小鼠投入200 ng總RNA，其他物種投入1000 ng總RNA；使用建庫試劑盒 (TransGen, KP701) 進行RNA文庫構(gòu)建后檢測文庫產(chǎn)量。
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 目錄號 | 規(guī)格 |
TransNGS? RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina? | KP601-01 | 12 rxns |
KP601-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina? | KP701-01 | 12 rxns |
KP701-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for MGI? | KP801-01 | 12 rxns |
KP801-02 | 96 rxns | |
TransNGS? rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) | KD101-11 | 12 rxns |
KD101-02 | 24 rxns | |
KD101-03 | 96 rxns | |
TransNGS? rRNA Depletion Kit (Bacteria) | KD201-11 | 12 rxns |
KD201-02 | 24 rxns | |
KD201-03 | 96 rxns | |
TransNGS? rRNA Depletion Kit (Animal) | KD301-11 | 12 rxns |
KD301-02 | 24 rxns | |
KD301-03 | 96 rxns | |
MagicPure? mRNA Kit | EC511-01 | 24 rxns |
EC511-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Circularization Kit For MGI? | KC101-01 | 12 rxns |
KC101-02 | 96 rxns | |
MagicPure? RNA Beads | EC501-01 | 1 ml |
EC501-02 | 5 ml | |
EC501-03 | 60 ml | |
TransNGS? Library Amplification SuperMix | KA101-01 | 1 ml |
KA101-02 | 5×1 ml | |
TransNGS? Library Quantification Kit for Illumina? | KQ101-01 | 100 rxns |
KQ101-02 | 500 rxns | |
TransNGS? Library Quantification qPCR SuperMix | KQ201-01 | 1 ml |
KQ201-02 | 5×1 ml | |
TransNGS? Library Quantification DNA Standards (S1-S6) | KS101-21 | 50% , 120 μl each |
TransNGS? Library Dilution Buffer | KB101-01 | 5×1 ml |
TransNGS? Single Index Primers Kit for Illumina? (Set 1) | KI201-01 | 48 rxns |
KI201-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Single Index Primers Kit for Illumina? (Set 2) | KI211-01 | 48 rxns |
KI211-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Single Index Primers Kit for Illumina? (Set 3) | KI221-01 | 96 rxns |
KI221-02 | 192 rxns | |
TransNGS? Dual Index Primers Kit for Illumina? | KI231-01 | 48 rxns |
KI231-02 | 96 rxns | |
TransNGS? Index Primers (384) Kit for Illumina? | KI241-01 | 96 rxns |
KI241-02 | 384 rxns | |
TransNGS? UDI Indexed Adapter Kit for Illumina? | KI341-01 | 192 rxns |
KI341-02 | 384 rxns | |
TransNGS? 384 UDI Indexed Adapter Kit for Illumina? | KI351-01 | 192 rxns |
KI351-02 | 384 rxns | |
TransNGS? Indexed Adapter Kit for MGI? | KI401-S1-3-01 | 10 μl/Index |
KI401-S1-3-02 | 40 μl/Index |
